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利用深度学习从转录谱中预测药效

个人感觉也没啥,其实本质上就是预测一个化合物是否对某个基因有影响,只不过这篇文章是多任务学习,或者直接就是多分类

基因表达谱

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在分子生物学领域,基因表达谱是同时测量数千个基因的活性(表达),以创建细胞功能的全局图。例如,这些配置文件可以区分活跃分裂的细胞,或显示细胞对特定治疗的反应。许多此类实验同时测量整个基因组,即存在于特定细胞中的每个基因。

几种转录组学技术可用于生成分析所需的数据。DNA 微阵列[1]测量先前确定的靶基因的相对活性。基于序列的技术,如RNA-Seq,除了提供基因表达水平外,还提供有关基因序列的信息。

在这里插入图片描述
基因表达变化模式 药物敏感性

系统生物学可以理解通路激活吗?基因表达特征作为了解通路激活复杂性的替代标记

基因表达特征和通路特征

基因签名

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