NCBI数据库本地化
Step3:查看可下载的数据库。Step1:下载blast+step4:下载对应的数据库。Step2:安装依赖。
·
Step1:下载blast+
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
Step2:安装依赖
dnf install perl-Archive-Tar
dnf install perl-JSON-PP
Step3:查看可下载的数据库
perl ncbi-blast-2.16.0+/bin/update_blastdb.pl –showall
截止2025-05 NCBI blast本地化可下载数据库 ::
B
etacoronavirus
ITS_RefSeq_Fungi
28S_fungal_sequences
18S_fungal_sequences
ITS_eukaryote_sequences
LSU_eukaryote_rRNA
LSU_prokaryote_rRNA
16S_ribosomal_RNA
SSU_eukaryote_rRNA
env_nt
env_nr
human_genome
landmark
mito
mouse_genome
nr
nt_euk
nt
nt_others
nt_prok
nt_viruses
pataa
patnt
pdbaa
pdbnt
ref_euk_rep_genomes
ref_prok_rep_genomes
ref_viroids_rep_genomes
ref_viruses_rep_genomes
refseq_select_rna
refseq_select_prot
refseq_protein
refseq_rna
swissprot
tsa_nr
tsa_nt
taxdb
core_nt
step4:下载对应的数据库
perl ncbi-blast-2.16.0+/bin/update_blastdb.pl nt_viruses --decompress
DAMO开发者矩阵，由阿里巴巴达摩院和中国互联网协会联合发起，致力于探讨最前沿的技术趋势与应用成果，搭建高质量的交流与分享平台，推动技术创新与产业应用链接，围绕“人工智能与新型计算”构建开放共享的开发者生态。
更多推荐
1
0- 0
已为社区贡献2条内容
所有评论(0)