lammps计算聚合物例子_(从examples的简单例子,到完成自己的科研课题)LAMMPS分子动力学技术与应用专题...
1 分子动力学模拟入门理论——掌握LAMMPS的in文件中各命令的意义1.1系综理论1.2主要算法介绍1.3积分步长的选取1.4温度和压力控制1.5周期性边界条件1.6分子动力学模拟流程2 LAMMPS入门操作基础2.1 Linux命令入门基础——掌握运行LAMMPS常用的Linux命令2.2 LAMMPS中一些安装包的介绍——为以后创建自己体系进行选择性安装2.3 LAMMPS的linux版串行
1 分子动力学模拟入门理论——掌握LAMMPS的in文件中各命令的意义
1.1系综理论1.2主要算法介绍1.3积分步长的选取1.4温度和压力控制1.5周期性边界条件1.6分子动力学模拟流程
2 LAMMPS入门操作基础2.1 Linux命令入门基础——掌握运行LAMMPS常用的Linux命令2.2 LAMMPS中一些安装包的介绍——为以后创建自己体系进行选择性安装2.3 LAMMPS的linux版串行和并行及GPU版编译安装——掌握LAMMPS的编译方法,针对自己体系编译可执行文件。2.4 LAMMPS的in文件结构格式,基本语法及常用命令讲解、data文件格式。2.5 LAMMPS实例讲解。
3 LAMMPS建模——掌握基本操作流程3.1 LAMMPS各种参数计算3.1.1 颗粒模拟3.1.2 可视化快照3.1.3 弹性常数模拟3.1.4 计算热导率3.1.5 计算粘度3.1.6 计算均方位移3.1.7 计算径向分布函数3.1.8 计算扩散系数3.1.9 计算能量数据3.1.10 Lammps常见错误及解决途径
实例操作:学员结合自己的科研方向,选择运行契合自己研究方向的例子
3.2 lattice命令语法学习及建模实操(金属、合金等晶体建模)
4 LAMMPS建模——掌握基本操作流程
4.1 根据分子结构绘制小分子模型、多个模型的合并处理,添加力场及使用msi2lmp.exe工作得到data文件
4.2 VMD、OVITO建模学习及实操(用于建模\模型及轨迹文件显示分析处理等)
实例操作:把上述实操模型转换成lammps的data文件
5 通过examples中的例子,理解要模拟对象的物理意义
5.1 运行examples\flow 两个简单例子并做可视化处理
练习与思考:
5-1 把二维couette流动扩展成三维,并输出流体的速度和密度分布
5-2 把二维poiseuille流动扩展成三维,并输出流体的速度和密度分布
5-3 建立三维管道内的poiseuille流动
5-4 进行石墨烯通道内的Couette流动和Poiseuille流动模拟
5-5 调节通道表面电荷性质、亲疏水性质,分析其对流动性质的影响
5-6 模拟体系中水更改为KCl溶液
5.2 运行并理解examples\shear 到石墨烯、金属钛拉压模拟
5.3 运行并理解examples\friction 到金属/合金的摩擦模拟
6 环氧树脂在二氧化硅表面吸附吸能的影响
7 夹层结构(graphene/C60/graphene)不同粗糙度条件下的摩擦性能研究(复杂模型采用多种建模方式组合而成)
7-1 建立夹层结构(graphene/C60/graphene)不同粗糙度的初始模型
7-2 夹层结构的应力-应变曲线性能研究
7-3 夹层结构摩擦性质研究
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联系人:孟老师 电话:15932325652(同微信)

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