近几年内，很多国外测序公司（比如23andMe、FTDNA等），他们将类似于 Illumina Omni Express 芯片或其他的位点集替换成了类似于 Illumina GSA 芯片的位点集，且它们一般体现为定制芯片数据。
特此，我做了一些对比图，以方便查找哪些芯片格式更接近 GSA（Global Screening Array）的位点集。为了方便对比，我也加入了几种近似于GSA位点集的对照格式。
（以下数据皆用DNA Kit Studio V2.8转化）

1.国内格式转国外与 GSA 相关格式的转化率图（按基因位点位置转化）

2.国内格式转国外与 GSA 相关格式的未检出位点数图

3.上述格式跑一些祖源计算器的理想利用率图（这里的原始数据文件第4列都填满了纯合位点，其中“[#ANY]”代表这个系列下的任意一个计算器）

很多祖源计算器大多诞生于8~10年前（从今年2021年算起），其所需位点集更偏向于 Illumina Omni Express，比如，Dodecad K12b、Globe13，Eurogenes K15、K36，LM Genetics K47 等。对了，E11 也是属于这类位点集偏向。
也有部分计算器的所需位点集也会偏向于 Affymetrix Human Origins，比如，LM Genetics K47，MDLP K11e，MDLP K16 等。
而偏向 Illumina GSA 位点集的祖源计算器很少，相关的只有 DNA Genics World K4、K7、K8。不过也不必太担心，未来可能会有更多的新祖源算法采用类似于GSA的位点集，甚至类似于 GDA（Global Diversity Array）的位点集，但不一定是祖源计算器。相对国内的话，Illumina 的 ASA（Asian Screening Array）和 CGA（Chinese Genotyping Array）也是分别被用作各色DNA V2、微基因3.0 的定制芯片的基础位点。

后面的文章将继续对比其他芯片类型的数据。

下图是一些国外测序格式的对应芯片类型，其中 FTDNA 对应的V2版，LivingDNA 对应的V1版，MyHeritage 对应的V1版：