基于Python计算机视觉入门与实践
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MedSAM本地部署:

  • 本地部署

打开Anaconda prompt

  1. 虚拟环境创建:conda create -n medsam python=3.10 -y

  1. 激活虚拟环境:conda activate medsam

  1. 进入项目所在文件夹,如:

D:

D:\liu\Project\MedSAM-main(进入上述网址将项目下载到本地)

  1. 安装对应版本的pytorch:pip install torch==2.2.0 torchvision==0.17.0 torchaudio==2.2.0 --index-url https://download.pytorch.org/whl/cu121(不可使用镜像加速,否则安装cpu版本)

  1. 使用项目的安装模块进行依赖安装:(pip install -e .)

可以加上-i http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple --trusted-host mirrors.aliyun.com 使用阿里源加速

  1. 进入MedSAM - Google Drive 将模型下载解压缩至项目中的(work_dir\MedSAM)路径中

  1. 在anaconda终端输入命令运行工具:python MedSAM_Inference.py

命令行参数增加:

-i input_img #输入图像

-o output path #输出路径

--box bounding box of the segmentation target #需分割区域

也可直接修改MedSAM_Inference.py文件中的默认参数

坐标与对应参数如图所示(所需参数为左下坐标与右上坐标)

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