r语言进行go富集分析_用这两个数据库做GO富集分析也太强了吧
相信很多人都知道用DAVID做GO富集分析总是被吐槽,数据更新实在是太慢了,太慢了,但是很多人又不想用R包和Cytoscape来做,因为很多时候安装包太麻烦了,还是觉得在线分析比较好。下面我们就推荐两个网站:第一个就是string数据库;第二个就是Metascape数据库。下面就是对应的网址(这样就是不需要老是百度):string数据库:https://string-db.org/Metascap
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相信很多人都知道用DAVID做GO富集分析总是被吐槽,数据更新实在是太慢了,太慢了,但是很多人又不想用R包和Cytoscape来做,因为很多时候安装包太麻烦了,还是觉得在线分析比较好。下面我们就推荐两个网站:第一个就是string数据库;第二个就是Metascape数据库。
下面就是对应的网址(这样就是不需要老是百度):string数据库:https://string-db.org/Metascape数据库:http://metascape.org/gp/index.html#/main/step1下面进行操作演示:
string数据库
1、登陆网址,如下图进行操作
2、拷贝差异基因,选择物种
3、等待结果、
Metascape数据库
1、登陆网址,提交差异基因,选择物种
2、查看结果
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