TCGA+GEO数据单基因在线生存分析

相比于gepia2 数据库的分析结果，可以以最佳cutoff值进行分割分析。可以选择泛癌或者单个肿瘤。（也可以使用GEPAI2。，不能自动分析最佳cutoff值）

hx2024

1681人浏览 · 2024-07-19 12:20:41

hx2024 · 2024-07-19 12:20:41 发布

基因查询常用汇总网（多数据库）_ccds的基因怎么查询是什么意思-CSDN博客

Kaplan-Meier plotter (kmplot.com)

GEO在线分析

以TP53为例

以中位数进行分析的结果（左）；以最佳cutoff分析结果（右）

进行TCGA的泛癌生存分析

相比于gepia2 数据库的分析结果，可以以最佳cutoff值进行分割分析。可以选择泛癌或者单个肿瘤。（也可以使用GEPAI2GEPIA 2 (cancer-pku.cn) ，不能自动分析最佳cutoff值）

数据库：

Kaplan-Meier plotter [Pan-cancer RNAseq, TCGA survival] (kmplot.com)

GEPIA 2 (cancer-pku.cn)

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